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當前位置:首 頁 >> 新聞中心: 利用PubReMiner彙總分析PubMed查詢結果提高查詢效率

利用PubReMiner彙總分析PubMed查詢結果提高查詢效率

添加時間:2015-11-3

利用PubReMiner彙總分析PubMed查詢結果提高查詢效率,可以對PubMed查詢結果進行彙總分析,不僅可以明顯的提高PubMed查詢效率,而且還可以掌握最新的研究動態。

PubReMiner 是 PubMed 資料分析工具,可以對 PubMed 查詢結果進行彙總分析,並且按照不同有的顯示方式顯示出來。從而對 PubMed 的查詢結果有個總體把握和認識。PubReMiner 可以統計的項目有出版年份、期刊、作者、國家、MeSH等等很多內容。

這方麵的工具也有其它優秀應用,如Web of Knowledge,可是它卻是收費的。相反,PubReMiner 卻是免費的!如此優秀的應用怎能不介紹給大家。廢話少說,來看看如何使用。

PubReMiner的使用方法

首先要進入http://hgserver2.amc.nl/cgi-bin/miner/miner2.cgi,界麵如下。

利用PubReMiner彙總分析PubMed查詢結果提高查詢效率

在「Start remining PubMed for」輸入 PubMed 檢索式。PubMed 檢索式如何編寫?可以利用 PubMed 高級搜索功能編寫。當然,如果您是檢索大牛的話,對於 PubMed 檢索式了然於胸,也可以直接編寫。反正我不會,記不住那麼多規則,我隻會「Advanced Search」。

我以曾經檢索過的一個檢索式來說明一下。

把輸入PubMed 檢索式「(((HIV[MeSH Terms]) AND tuberculosis[MeSH Terms])) OR ((tuberculosis[MeSH Terms]) AND AIDS[MeSH Terms])」輸入到「Start remining PubMed for」,其它默認即可。

然後「Start PubReMiner」,會得到一個界麵。

在新界麵中「Search with Manual Adjustment」

利用PubReMiner彙總分析PubMed查詢結果提高查詢效率

命中2821篇文獻,可是默認顯示的是1000篇。把「Abstract Limit」調成10000篇。

如果想顯示快些,可以把右側的「columns to display」不顯示「mesh」「substance」和「word」。

之後會得到如下結果

利用PubReMiner彙總分析PubMed查詢結果提高查詢效率

PubReMiner 已經把所有文獻按照發表年代,雜誌,作者等分類了。

從這個結果中我們可以看到,發表此類文章最多是的Lancet,此類研究最多的大牛。當然第一個作者「ET AL」不是作者。

點擊右側的「P」,可以回到 PubMed 看到有關此項的研究。找個大牛看看。我們以第二位作者「CHAISSON RE」為例,點擊右側的「P」,可以看到CHAISSON RE所有的發表文獻。這位大牛居然發表了318篇!牛人啊就是牛人。

利用PubReMiner彙總分析PubMed查詢結果提高查詢效率

在Google裏搜索一下這位牛人

利用PubReMiner彙總分析PubMed查詢結果提高查詢效率

找到其主頁

利用PubReMiner彙總分析PubMed查詢結果提高查詢效率

原來是Johns Hopkins University的一位教授,上麵還有他的經曆和發表文獻。如果您想繼續此方麵的研究,可以考慮申請他的博士。

有的教授還有FaceBook主頁,同樣可以找,甚至E-Mail了,Tel了的,都可以找到,聯係他吧。

PubReMiner重新搜索

點擊需要添加的內容,在左側選中,如我們隻想看發表於 Lancet 和N Engl J Med的文章,選中之後再「Search Again」,會把隻發表於Lancet 和N Engl J Med的文章篩選出來,通過上方的「Goto PubMed with query」,又可以回到 PubMed 看到這些結果的具體情況。

利用PubReMiner彙總分析PubMed查詢結果提高查詢效率

另外,還可以把彙總分析的結果導出為TXT文檔,再通過Excel分析。

PubReMiner的價值

麵對當今信息過剩的年代,PubMed 上的資料也越來越多,我們無法知道哪些東西是有意義的。當然我們可以利用一些工具篩查一下文獻,如:

但是PubReMiner 的價值還不在於此,PubReMiner不僅過濾信息,把最好結果呈遞給我們,而且還有許多更好的應用。我稍微總結了一下。

1、篩查 PubMed 信息。

2、提供研究趨勢,可以根據發表年代的文獻數量,看出這方麵的研究是增加還是在減少。因此利用這個,可以初步考慮一下進行此方麵的研究是否有價值。

3、提供投稿方向。根據相應發表此類文獻的雜誌,可以初步考慮一下向何種雜誌投。當然發表此類文獻最多的雜誌是首選,因為編輯們對此方麵感興趣。如果一個雜誌此類研究尚未發表一個,決定投此雜誌之前要考慮一下了。

4、提供了世界上誰在做此類研究。根據作者信息,可以看到此類研究最多的大牛是誰。如果想外出深造,當然首選此類大牛。出研究成果的機率也就大大的增加。通過Google完全可以找到此位大牛在哪,有啥聯係方式。唉,現今社會,人還有隱私嗎?!

5、相比於Web of Knowledge免費,這點很重要。

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